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RCB0300 - Tópicos em Biotecnologia III - Genética - 2024
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RCB0300 - Tópicos em Biotecnologia III - 2024
P6. Análise in sílico: Contagem das leituras mapea...
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Contagem das leituras mapeadas no genoma de referência
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08 - Contagem.pdf
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Avisos
PEA com Roteiro de Aulas
Apresentação
Lista alunos para os seminarios
Instruções dos seminários
Sobre o seminarios - pdf da aula
Lista alunos para seminarios com datas
Apresentações
Nota Final
Questões para sala de aula
Respostas Questão 1
Slides da aula
Material_complementário_RNAseq
Material_Complementario_Splicing
Overview of Illumina Sequencing by Synthesis Workflow
Desenho Experimental
Criando Conta Galaxy
Roteiro da Aula Prática 01
MaterialComplementário_Galaxy
Análise de qualidade do sequenciamento
Aparar (“trimar”) leituras do RNA-Seq
Mapear leituras ao genoma de referência
Mapeamento das leituras no genoma de referência Parte 2
BAMvs.SAM
Contagem das leituras mapeadas no genoma de referência
Normalização dos dados
Exemplo de Cálculo - DESeq2
Normalização dos dados
Reference-based RNA-Seq data analysis - Galaxy
Cálculo da expressão diferencial e resultados
Tratamento dos resultados
Planilha de anotação T. rubrum
Análise da correlação entre as amostras
12 - Splicing Alternativo
Analisar-IR
Material Adicional - The physiology of alternative splicing
Análise de expressão gênica diferencial
ColabFold: uma ferramenta web para modelagem de proteínas
Respostas da avaliação do dia 05/04
Aula - PDF
Slides Aula T5
T5: Questão
Gisaid_Linhagem Original
Gisaid_Linhagem Atual
P13: Questões
Sequência Fasta Genoma Completo da linhagem viral atual
Sequência Fasta Genoma Completo do virus original (Wuham)
Sequência Fasta do cDNA da proteína spike do virus original (Wuham)
Sequencia Fasta do cDNA da proteína spike da linhagem viral atual
Documento word Genoma SARS-CoV-2 original (Wuham)
Documento word: linhagem viral atual (Bélgica)
Primer show: tradução da proteína spike do virus original (Wuham)
Primer Show: tradução da spike da linhagem viral atual
Aula_Teórica
Roteiro 1
P14 - Questões
Roteiro - Aula Prática 2
Codons Otimizados Spike Original (Wuham)
Codons otimizados spike atual
How COVID-19 mRNA Vaccines Work
Questões P16 múltipla escolha
Questões P16 - dissertativas
Roteiro 3 - Módulo 2
Apresentação dos Resultados
Contagem das leituras mapeadas no genoma de referência ►