RCB0300 – Tópicos em Biotecnologia III - 2022

P3. Análises in silico: mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1.

• P3. Análises in silico: mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1.

  Data: 25 de Março (10:10 - 12:00)

  Professores: Pablo R. Sanches, Nilce M. Rossi e Aparecida M. Fontes
  

  Objetivos: ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:

  • Aplicar algoritmos para indexação do genoma de referência e mapeamento das reads (leituras) contra o genoma de referência; 
  • Ao final, criar uma tabela contendo a quantidade e o percentual de reads mapeadas por amostra.
    

  
  Roteiro da análise:
  

  • Enviar arquivos do genoma para o Galaxy
    
  • RNA STAR (mapeamento das bibliotecas de leituras contra o genoma de referência)
  • Finalizar a tabela de resultados sobre as características gerais das bibliotecas sequenciadas

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    P3_Mapeamento de Leituras File