RCB0300 – Tópicos em Biotecnologia III - 2022

T2.Conceitos Fundamentais sobre a metodologia para análises de bancos de RNAseq

• T2.Conceitos Fundamentais sobre a metodologia para análises de bancos de RNAseq

  Data: 23 de Março (8:00-10:00)

  Professores: Pablo R. Sanches, Nilce M. Rossi e Aparecida M. Fontes
  

  Objetivos: ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:

  • Conhecer os passos para análise dos RNAs-seq;
  • Conhecer os programas disponíveis para análises online dos mesmos.

  
  

  Principais tópicos abordados:

  • Tipos de sequenciamento (single-end e paired-end)
  • Pipeline do RNA-seq
  • Análise da qualidade do sequenciamento
  • Processo de trimagem das reads
  • Alinhamento das reads
  • Expressão diferencial 
  • Enriquecimento funcional (identificar classes de genes que estão super-representadas em um grande conjunto de genes)
  • Principais softwares utilizados

  
  

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    Conceitos Fundamentais - RNASeq Datei