Seção: P9. Análises in silico: análise de expressão gênica diferencial – Parte 1 | RCB0300 – Tópicos em Biotecnologia III - 2022 | e-Disciplinas
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P9. Análises in silico: análise de expressão gênica diferencial – Parte 1
Data: 4 de abril (8:00 - 10:00)
Professores: Pablo R. Sanches, Nilce M. Rossi e Aparecida M. Fontes
Objetivos: ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:
- Utilizar algoritmos para identificação dos genes diferencialmente expressos;
- Conhecer as análises de expressão gênica global utilizando diagrama de Venn: https://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
- Conhecer a busca de informações no banco de dados Gene Ontology: http://geneontology.org/
- Compreender os passos para a análise de genes diferencialmente expressos utilizando o banco FungiFun e a classificação GO: https://sbi.hki-jena.de/fungifun/fungifun.php
Questões: exemplo:
- Em uma análise inicial sobre o panorama geral, há diferença na quantidade de genes diferencialmente expressos por categoria do GO quando comparado os dois tempos (2 e 12 hs)? Quais as similaridades? Quais as diferenças?
- Há diferença na análise do panorama geral conforme o tipo de classificador utilizado: GO ou FunCat? Quais as diferenças e similaridades observadas nos tempos de 3 e 12 horas utilizando esses dois classificadores?