Section: P3. Análises in silico: mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1. | RCB0300 – Tópicos em Biotecnologia III - 2022 | e-Disciplinas

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P3. Análises in silico: mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1.

  • P3. Análises in silico: mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1.

    Data: 25 de Março (10:10 - 12:00)

    Professores: Pablo R. Sanches, Nilce M. Rossi e Aparecida M. Fontes

    Objetivos: ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:

    • Aplicar algoritmos para indexação do genoma de referência e mapeamento das reads (leituras) contra o genoma de referência; 
    • Ao final, criar uma tabela contendo a quantidade e o percentual de reads mapeadas por amostra.


    Roteiro da análise:

    • Enviar arquivos do genoma para o Galaxy
    • RNA STAR (mapeamento das bibliotecas de leituras contra o genoma de referência)
    • Finalizar a tabela de resultados sobre as características gerais das bibliotecas sequenciadas