RCB0300 - Tópicos em Biotecnologia III - Genética - 2024

T2. Conceitos Fundamentais sobre a metodologia para análises de bancos de RNAseq

• T2. Conceitos Fundamentais sobre a metodologia para análises de bancos de RNAseq

  Data: 08 de Março (08:00 - 10:00)

  SALA: Pró-Aluno

  Professores: Dr. Pablo R. Sanches, Profa. Dra. Nilce M. Rossi e Profa. Dra. Aparecida M. Fontes

  Objetivos: Ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:
  

  • Conhecer os passos (pipeline) para a análise de RNA-Seq 
  • Conhecer os programas disponíveis para análises online dos mesmos

  
  

  Principais tópicos abordados:

  • Tipos de sequenciamento (single-end e paired-end);
  • Pipeline do RNA-seq;
  • Análise da qualidade do sequenciamento;
  • Processo de trimagem das reads;
  • Alinhamento das reads;
  • Expressão diferencial;
  • Enriquecimento funcional (identificar classes de genes que estão super-representadas em um grande conjunto de genes);
  • Principais softwares utilizados.

  
  

  Alunos PAE: Gabriel Montenegro de Campos e Cleidy Osorio Mogollon

  
  

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    01 - Conceitos Fundamentais - RNASeq Arquivo

    Disponível se: Você faz parte de T-RCB0300-20241T1
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    Overview of Illumina Sequencing by Synthesis Workflow URL

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    Explore the Illumina next-generation sequencing workflow, including sequencing by synthesis (SBS) technology, in 3-dimensional detail. Go from sample preparation, to cluster generation, to sequencing on a system flow cell with the proprietary SBS process, through to data analysis on the BaseSpace Sequence Hub. #Illumina #sequencingbysynthesis #nextgensequencing