Seção: P10. Análise in sílico: Análise de expressão gênica diferencial | RCB0300 - Tópicos em Biotecnologia III - Genética - 2024 | e-Disciplinas

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P8. Análise in sílico: Análise da correlação entre as amostras
P11. Análises in sílico: análise de genes de interesse

P10. Análise in sílico: Análise de expressão gênica diferencial

  • P10. Análise in sílico: Análise de expressão gênica diferencial

    Data: 03 de abril (8:00 - 10:00)

    SALA: Pró-aluno II

    Professores: Dr. Pablo R. Sanches, Profa. Dra. Nilce M. Rossi e Profa. Dra. Aparecida M. Fontes

    Objetivos: Ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:

    • Utilizar algoritmos para identificação dos genes diferencialmente expressos; 
    • Conhecer as análises de expressão gênica global utilizando diagrama de Venn: https://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/  
    • Conhecer a busca de informações no banco de dados Gene Ontology: http://geneontology.org/
    • Compreender os passos para a análise de genes diferencialmente expressos utilizando o banco FungiFun e a classificação GO: https://sbi.hki-jena.de/fungifun/fungifun.php

    Questões: examplo:

    • Em uma análise inicial sobre o panorama geral, há diferença na quantidade de genes diferencialmente expressos por categoria do GO quando comparado os dois tempos (2 e 12 hs)? Quais as similaridades? Quais as diferenças?
    • Há diferença na análise do panorama geral conforme o tipo de classificador utilizado: GO ou FunCat? Quais as diferenças e similaridades observadas nos tempos de 3 e 12 horas utilizando esses dois classificadores?

    Alunos PAE: Cleidy Osorio Mogollon e Gabriel Montenegro de Campos

P8. Análise in sílico: Análise da correlação entre as amostras
P11. Análises in sílico: análise de genes de interesse