RCB0300 - Tópicos em Biotecnologia III - Genética - 2024

P3. Análises in silico: Mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1

• P3. Análises in silico: Mapeamento das leituras no genoma de referência – Parte 1

  Data: 13 de Março (10:10 - 12:00)

  SALA: Pró-aluno

  Professores: Dr. Pablo R. Sanches, Profa. Dra. Nilce M. Rossi e Profa. Dra. Aparecida M. Fontes
  

  Objetivos: Ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:

  • Aplicar algoritmos para indexação do genoma de referência e mapeamento das reads (leituras) contra o genoma de referência; 
  • Ao final, criar uma tabela contendo a quantidade e o percentual de reads mapeadas por amostra.
  • Responder questões no moodle.
    
    

  Roteiro da análise:
  

  • Enviar arquivos do genoma para o Galaxy;
    
  • RNA STAR (mapeamento das bibliotecas de leituras contra o genoma de referência);
  • Finalizar a tabela de resultados sobre as características gerais das bibliotecas sequenciadas.

  
  Alunos PAE: Cleidy Osorio Mogollon e Gabriel Montenegro de Campos
  

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    06 - Mapeamento - P1 Arquivo

    Disponível se: Você faz parte de T-RCB0300-20241T1
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    Mapear leituras ao genoma de referência Questionário

    Fechado: terça-feira, 19 mar. 2024, 23:59