Section : T2. Conceitos Fundamentais sobre a metodologia para análises de bancos de RNAseq | RCB0300 - Tópicos em Biotecnologia III - Genética - 2024 | e-Disciplinas
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T2. Conceitos Fundamentais sobre a metodologia para análises de bancos de RNAseq
Data: 08 de Março (08:00 - 10:00)
SALA: Pró-Aluno
Professores: Dr. Pablo R. Sanches, Profa. Dra. Nilce M. Rossi e Profa. Dra. Aparecida M. Fontes
Objetivos: Ao longo da abordagem deste tópico os alunos deverão ser capazes de:
- Conhecer os passos (pipeline) para a análise de RNA-Seq
- Conhecer os programas disponíveis para análises online dos mesmos
Principais tópicos abordados:
- Tipos de sequenciamento (single-end e paired-end);
- Pipeline do RNA-seq;
- Análise da qualidade do sequenciamento;
- Processo de trimagem das reads;
- Alinhamento das reads;
- Expressão diferencial;
- Enriquecimento funcional (identificar classes de genes que estão super-representadas em um grande conjunto de genes);
- Principais softwares utilizados.
Alunos PAE: Gabriel Montenegro de Campos e Cleidy Osorio Mogollon
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01 - Conceitos Fundamentais - RNASeq Fichier
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Explore the Illumina next-generation sequencing workflow, including sequencing by synthesis (SBS) technology, in 3-dimensional detail. Go from sample preparation, to cluster generation, to sequencing on a system flow cell with the proprietary SBS process, through to data analysis on the BaseSpace Sequence Hub. #Illumina #sequencingbysynthesis #nextgensequencing