Programação

  • 7/3 Hardy Weinberg e contagem de alelos

  • 14/3 Deriva genética

    Orientação para preparação da aula:

    1. Leia o item 5.1, que revisa conceitos básicos do modelo de Hardy-Weinberg, que apresentei para vocês. 

    2. Prepare a lista de exercícios, respondendo às questões   1, 2, 3, e 4 (do documento "Exercícios HW. pdf", postado na aula anterior). 

    3. Leia a seção 5.3 sobre deriva genética, que será nosso tema na aula.

    Os itens 5.2, 5.4, 5.5 e 5.6 serão tratados em aulas posteriores.


    Algumas questões para nortear a leitura:

    1. Baseado no Box 5.1, discuta como o teste de HW revelou uma dinâmica evolutiva.

    2. Qual a diferença entre tamanho efetivo e tamanho de censo de uma população? Qual a diferença entre tamanho efetivo "long-term" e "recente"?

    3. Quais fatores biológicos são responsáveis por moldar o tamanho efetivo de uma população?

    3. Quais os efeitos da deriva genética sobre uma população?

    Tente responder às questões  5.1 e 5.2 no final do capítulo.


  • 21/03 Ligação, Recombinação e Desequilíbrio de Ligação

  • 28/3 Deriva Genética

    Deriva Genética.

    Para compreendermos o processo de deriva genética, descrito no texto que vocês leram, vamos fazer uma simulação usando bolas de cores diferentes para representar dois alelos que segregam numa população. O objetivo da atividade é desenvolver uma intuição sobre os efeitos de deriva em populações humanas e motivar conceitos como tamanho efetivo populacional e gargalo genético.

    A atividade

    A turma deve se dividir em duplas. Cada dupla pode utilizar um número ilimitado de bolinhas brancas e pretas e copinhos. O desafio será bolar um algoritmo (isto é, uma sequência de ações) que sirva para ilustrar o processo de deriva genética. Assuma que os alelos ocorrem em frequências iniciais de p=0,5 e q=0,5, numa população com exatamente 10 indivíduos (5 homens e 5 mulheres). 

    Após 15 minutos, cada grupo deve apresentar a estratégia que desenvolveu para decidirmos qual é aquela conceitualmente mais precisa e fácil de implementar. A seguir, todos os grupos irão  A simulação de compreender um total de 10 gerações e os resultados serão comparados. A discussão dos resultados deverá contemplar:

    - diferenças entre resultados de cada  grupo

    - evolução da diversidade ao longo do tempo


    Conceitos adicionais

    A seguir, discutiremos alguns conceitos adicionais ligados à deriva genética:

    - Tamanho efetivo populacional (quais fatores influenciam)

    - Probabilidade de fixação de uma mutação

    - Gargalos populacionais.

    Proponho então que sejam propostas alterações na simulação original, que permitam ilustar alguns desses conceitos.


    SImulação computacional

    Para encerrar, usaremos uma simulação computacional e discutiremos implicações dos achados para questões de variabilidade genética humana.


    https://phytools.shinyapps.io/coalescent-plot/


     





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