A necessidade de diversificar os sistemas de produção em função de restrições ambientais e econômicas traz consigo demandas por uma visão multidisciplinar que não será atendida pelo estudo dos subsistemas componentes de forma isolada. Desta forma os objetivos da disciplina são:
1) Estimular o pensamento sistêmico e sua aplicação na caracterização e resolução dos problemas comuns aos sistemas agrícolas;
2) Apresentar as principais técnicas e ferramentas empregadas pela engenharia de produção e abordar como pode ser realizada sua inserção na produção agrícola;