Menos relacionada a tumores, essa molécula possui domínios chamados BH (Bcl2 homology). Encontrada na forma ativa fracamente ligada à membrana mitocondrial e sequestra membros pró-apoptóticos, impedindo a liberação de citocromo c. Após receber estímulo de apoptose, a proteína BIM (activator subtype of BH3-only proteins) se liga à Bcl-w, inserindo-a na membrana mitocondrial e, dessa forma, impossibilitando o sequestro dos membros pró-apoptóticos. Bcl-w protege células da morte e por isso é encontrada em diversos tecidos como cólon, cérebro, testículos, células mieloides, linfoides e epiteliais.