Buscas em grafos
1.- Suponha que você esteja interessado(a) no mecanismo de replicação e reparo do DNA de humanos.
Analise a lista de genes dada seguir com o auxílio da plataforma de busca por genes relacionados GeneMANIA (disponível http://genemania.org) e, em seguida, explore os resultados da pesquisa e responda as questões abaixo. Ao clicar em cada abreviatura de gene você será direcionado(a) para o registro correspondente da plataforma UNIPROT (https://www.uniprot.org/). Note que as informações são para humanos, para outros organismos, refaça a busca com a abreviatura.
Nota: A busca do GeneMANIA atribui um peso percentual a cada uma das redes de acordo com a quantidade de genes mais conectados de sua entrada em relação aos outros genes de outras redes. Em seguida, é feita uma nova rede composta de uma lista específica que é igual a uma média ponderada das redes selecionadas. Depois, o mecanismo do GeneMANIA irá propagar essa rede composta a todos outros genes nas redes de acordo com a forma que eles estão associados aos genes da consulta. Uma vez que este processo é feito, GeneMANIA mostrará 20 genes (parâmetro padrão) mais fortemente associados juntos aos genes da consulta em uma rede. Uma vez retornada a rede você poderá ver que uma série de interações existentes ou previstas entre os genes.
Envie as respostas:
a.- Descreva como estão representados os resultados do geneMANIA.
b.- Como se pode encontrar os artigos que foram utilizados para fazer as conexões?
c.- Repita a busca com outro organismo modelo, de sua escolha, e compare os resultados
d.- A que você atribui as diferenças: Maior quantidade de pesquisa ou diferença na complexidade dos
organismos?