Programação

  • Docente Responsável
    Prof. Sergio Russo Matioli (srmatiol@ib.usp.br)

    Horário: Quartas-feiras, das 19h00 às 21h00

    Método didático
    As aulas teóricas envolverão um texto e explanação dos conceitos mais fundamentais. As aulas práticas constituir-se-ão em uma atividade executada pelos estudantes, de forma colaborativa, mas com a produção de materiais individuais.

    Avaliação
    Os estudantes serão avaliados pela média das notas atribuidas às atividades. 

  • Aula de 19/08/2020

    Bioinformática: Definições e Histórico

    Você receberá o link da vídeo-aula por e-mail. Solicito a gentileza de não repassá-lo.

    Disponível até o final de 30 de setembro de 2021
  • 26/08. Arquitetura de computadores

    Disponível até o final de 30 de setembro de 2021
  • 02/09. Algoritmos e programas.

    Disponível até o final de 30 de setembro de 2021
  • 09/09. Bancos de dados. Dados biológicos

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 16/09. Alinhamento de sequências macromoleculares em pares.

    Você deve ter recebido os links para a video-aula, para a aula remota e o texto correspondente por e-mail. Caso não o tenha recebido, verifique na caixa de entrada do e-mail registrado no sistema Júpiter ou entre em contato com o prfessor. 

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 23/09. Alinhamentos múltiplos de sequências

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 30/09. Filogenias moleculares.

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 07/10. Reconstruções filogenômicas.

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 14/10. Motivos, domínios, evolução por rearranjo de exons.

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 21/10. Semana temática da Biologia. Participe!

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 28/10.Estrutura de ácidos nucleicos.

    O link para a vídeo-aula, o link para a aula remota e o texto correspondente seguiram por e-mail.



    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 04/11. Estruturas de proteínas.

    Para esta aula, não haverá video-aula, mas a discussão de um texto. 

    O texto é o capítulo 7 (pg 148 livro/158 pdf) do livro:

    Verli, H. Bioinformática. Da biologia molecular à flexibilidade molecular. UFRGS, 2014

    Para aqueles que ainda não cursaram a disciplina "Bioquímica", ou para aqueles que já não se lembram muito do assunto "estrutura de proteínas", uma revisão pode ser encontrada aqui. Essa revisão será apresentada brevemente no início da aula online. A gravação dessa apresentação está aqui:

    V .




    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 11/11.Funcionamento de proteínas.

    Vídeo sobre atracação molecular:

     (em português)

    Vídeo sobre dinâmica molecular:

    (em inglês)

    Capítulos 8 e 9:

    Verli, H. Bioinformática. Da biologia molecular à flexibilidade molecular. UFRGS, 2014

    Vídeo bônus (opcional, assista caso tenha curiosidade sobre esse assunto: Biologia quântica*)

     (em português)

    * Não tem qualquer relação com cura quântica e outras pseudociências.

    Disponível se: Você faz parte de qualquer grupo
  • 18/11.Biologia de sistemas: Redes de expressão e interações.

    Texto: 

    Capítulo 6 (Biologia de sistemas):

    Verli, H. Bioinformática. Da biologia molecular à flexibilidade molecular. UFRGS, 2014

    Vídeo introdutório:
    Parte I:

    Parte II:
    https://youtu.be/u_EHmrA7CxU

    Sugestão de vídeo (ele fala muito rapidamente, mas é possível usar legendas em português, use a opção CC e clique no ícone da engrenagem para escolher português):
    Observação: a palavra "graph" é taduzida como "gráfico" mas, neste contexto, deveria ser "grafo".


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