Roteiro para discussão noturno
1. Assim como em vários outros artigos que lemos ao longo do curso, o tamanho efetivo populacional tem um papel central no trabalho de Lynch. Peço que vocês reflitam sobre isso, comentando como o Ne foi estimado neste estudo, quais os pressupostos inerentes a essa estimativa (assim como possíveis problemas) e qual o padrão geral encontrado. Use a figura 1 para sua resposta.
2. Todo o artigo do Lynch é baseado na ideia de que há uma interação constante entre as forças de deriva e de seleção. Faça um breve resumo dessas ideias, incluindo um comentário sobre o “limiar” que define qual das forças irá prevalecer. A ideia é transmitir ao restante da classe a ideia de que os efeitos da seleção podem mudar em função do tamanho populacional. Na sua resposta, quando apropriado, recorra à teoria quase neutra. (o seguinte texto ajuda: https://www.nature.com/scitable/topicpage/neutral-theory-the-null-hypothesis-of-molecular-839)
O artigo de Lynch e Conery é construído com base em 3 padrões principais: a distribuição de genes duplicados, a abundância e o tamanho de íntrons, a distribuição de elementos transponíveis. Vamos discutir cada um deles.
3. Diogo irá apresentar os achados sobre genes duplicados
4. Apresente os achados a respeito de íntrons e a respeito de elementos transponíveis.
5. Para nossa discussão final, vamos discutir se a hipótese de Lynch parece viável, se há formas de testá-la mais rigorosamente, e se ela representa uma “mudança radical” em termos de nosso modo de ver o aumento da complexidade. Recorra à entrevista dela dada numa visita ao Brasil (http://revistapesquisa.fapesp.br/2008/12/01/michael-lynch/) para obter citações interessantes.