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QBQ0250 - Bioquímica: Estrutura de Biomoléculas e Metabolismo (2023)
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QBQ0250-2023
Aula 3 - 15/08 Estrutura 3D de proteínas
Jabberwocky (de Lewis Carroll)
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A poema que inspirou a narração do vídeo
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Jabberwocky (de Lewis Carroll)
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Avisos
Livro texto: Marzzoco & Torres 3a Ed
Livro texto: Marzzoco & Torres 2a Ed
Livro texto: Voet & Voet 4th Ed
Livro texto: Voet & Voet 4th Ed português
Livro texto: Lehninger 6ed
INSTRUÇÕES E CRONOGRAMA
Avisos
Notas
Cronograma pós-paralisação
planilha com todas as notas_16.12.23
Media final
Média final pós-recuperação
Lehninger chap01 The foundations of biochemistry
Lehninger chap02 Water
Aula 1 - Aminoácidos, água, pH, pKa
Lehninger chap03 Aminoacids, peptides and proteins
Testar seu conhecimentos sobre estrutura e propriedades de aminoácidos e oligopeptídeos
Aula 2 - Purificação e Caracterização de Proteínas
Lehninger - Secção 3.3 e 3.4 de Capítulo 3
Testar seus conhecimentos sobre a purificação e caracterização de proteínas
Vídeo: Purificação de Proteínas
Prática 1 - Conhecendo bancos de dados de sequencias e estruturas
Video sobre Alinhamento de sequencias e identificação de domínios; um exemplo usando lactato desidrogenase
Tutoriais sobre uso de Pymol e UCSF Chimera
Vídeo: Como usar Pymol
Aula 3: Estrutura 3D de proteínas
Extra: Métodos para determinar a estrutura de proteínas
Video sobre Métodos experimentais de determinação de estrutura de macromoléculas
Lehninger Chapt. 4 Protein Structure
Creighton Chapt. 4 Interações físico-químicas que determinam as propriedades de proteínas
Tradução do RNA mensageiro
THE EPIC OF PROTEIN SYNTHESIS
Testar seus conhecimentos sobre a estrutura de proteínas
Vídeo: Aula 3a: Estrutura secundária de proteínas
Vídeo: Aula 3b: Estrutura terciária de proteínas
Video: Aula 3c: Enovelamento e desenovelamento de proteínas
Aula 4 - Hemoglobina
Lehninger Chapt. 5 Protein Function
Testar seus conhecimentos sobre a estrutura e função de hemoglobina
Hemoglobina: Estado T vs Estado R
2,3BPG ligando na Hb
Mioglobina (arquivo pdb)
Oxihemoglobina (arquivo pdb)
Dessoxihemoglobina (arquivo pdb)
Simulação de Y vs L
Perutz-Nobel lecture
Vídeo: Hemoglobina - parte 1
Vídeo: Hemoglobina - parte 2
A broad diversity in oxygen affinity to haemoglobin
Video sobre eletroforese
Prática de Laboratório - Purificação e SDS-PAGE de proteínas
Entregar relatório do laboratório até dia 01 de setembro
Grupo de Discussão - Aminoácidos e Proteínas
Aula 5 - mecanismos do catálise enzimática
Video: Como enzimas funcionam
Vídeo - Mecanismos de Catálise Enzimática
MECANISMO E ESPECIFICIDADE DE SERINA-PROTEINASES
Lisozima 1H6M
Ribonuclease 1JVU_3F30
Quimiotripsina 7GCH
Lehninger: Enzimas e Cinética Enzimática
Estudo dirigido para enzimas
Aula enzimas Profa Daniela Truzzi
Slides aula de enzimas
Aula cinética enzimática Profa Daniela Truzzi
Roteiro aula prática
Cinética enzimática - linearização dos dados
Dúvidas sobre o relatório
Relatório Aula Enzimas
Questões para Estudo e Grupos de Discussão
Apostila parte III
Questões sobre este tópico
Slides da aula Introdução ao Metabolismo
Slides comentados: Estrutura de carboidratos
Vídeo aula glicólise - Parte I
Slides Metabolismo de Carboidratos - Glicólise parte I
Vídeo Aula - Glicólise parte II
Slides Metabolismo de Carboidratos - Glicólise parte II
Slides comentados Ciclo de Krebs
Vídeo-aula Ciclo de Krebs_Prof Regina
Vídeo aula Cadeia Respiratória e Fosforilação Oxidativa
Slides da aula Cadeia transportadora de elétrons
Vídeo aula Espécies Reativas de Oxigênio
Vídeo-aula Gliconeogênese
Vídeo-aula Regulação da Gliconeogênese
Vídeo-aula Via das Pentoses Fosfato
Slides da aula gliconeogênese/via das pentoses fosfato
Vídeo-aula Metabolismo do Glicogênio
Vídeo-aula transdução de sinal
Slides aula Metabolismo do Glicogênio
Slides da aula de transdução de sinal
Apostila Parte IV
Vídeo-aula Estrutura de Lipídeos
Slides da aula Estrutura de lipídeos
Vídeo-aula Lipoproteínas plasmáticas
Slides aula Lipoproteínas plasmáticas
Vídeo-aula oxidação dos ácidos graxos e síntese de corpos cetônicos
Slides aula - oxidação dos ácidos graxos e síntese e corpos cetônicos
Vídeo-aula Biossíntese de Ácidos Graxos e Triacilgliceróis
Slides aula Biossíntese dos AG
Vídeo-aula metabolismo de aminoácidos_Prof Alícia
Slides aula aminoácidos
Artigo para responder a questão 10 do ED aminoácidos
Vídeo-aula Integração do Metabolismo
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