Skip to main content
Side panel
Disciplinas »
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
2015
2014
2013
2012
AACCs/FFLCH
Pró-Reitoria de Pós-Graduação
Outros
Suporte »
Acesso
Perfis
Ouvintes
Docentes
Criação de Disciplinas da USP
Documentação
HelpDesk e Contato
Guia de uso
Sobre
English (en)
Deutsch (de)
English (en)
Español - Internacional (es)
Français (fr)
Italiano (it)
Português - Brasil (pt_br)
Search
Close
Search
Toggle search input
Acessar
QBQ2505 - Biologia Estrutural (2023)
Home
Courses
2023
IQ
QBQ
QBQ2505-2023
Simulações de dinâmica molecular
Exercício 5
Exercício 5
Exercício sobre minimização de energia para ser realizado com o programa UCSF Chimera
Click
exercício 5.pdf
link to view the file.
◄ Link do video 2 sobre o exercício de DM
Jump to...
Jump to...
Avisos
Informações Gerais e Cronograma
Notas e Médias Finais
Sugestão de Leitura - Aulas 1 e 2
Sugestão de Leitura - Estabilidade de Proteínas
Texto - Estabilidade de Proteínas
Slides - Estrutura de Proteínas e Classificação
Slides de Aula - Estabilidade de Proteínas
Comentários sobre a Resolução do Exercício 1
Notas - Exercício 1
Breve descrição de difração de raios X por cristais
Links para vídeos sobre cristalografia
Cristais e simetria
Representação vetorial de ondas
Difração por um cristal
Jan Drenth: Principles of Protein X-ray Crystallography
Gale Rhodes: Crystallography made crystal clear
Somar ondas
Sites para baixar Pymol, Coot e Phenix
Tutoriais sobre o uso de Pymol e UCSF Chimera
Cristalografia - Estimando as fases até o modelo final
Projeto: Determinação da estrutura de lisozima (ENTREGAR ATÉ 08 de JUNHO)
Modelo polyA
lysozyme_intensities.mtz
lysozyme_intensities.ref
datacollection_log.txt
lysozyme_seq_fasta
ENTREGA DE DOCUMENTOS
Notas de aula
Provinha 2
Texto de revisão sobre GroEL/GroES
Reportagem sobre AlphaFold
Slides de aula - teoria
Capítulo sobre RMN de proteínas
Figura
Slides de aula - RMN nD heteronuclear
Slides de aula
Interações intermoleculares
Link do video 1 sobre o exercício de DM
Link do video 2 sobre o exercício de DM
Videoaula sobre dinâmica molecular - Parte 1
Videoaula sobre dinâmica molecular - Parte 2
Tarefa sobre dinâmica molecular
Trajetória hélice
Trajetória beta
Slides da Aula sobre SAXS
Slides da Aula sobre Predição da Estrutura Terciária de Proteínas
Mini-tutorial - PyMOL
Notas - Exercícios
Lista de exercicio 1
Lista de exercicio 2
Lista de exercício 3
Lista de exercício 4
Lista de exercício 5
Lista de exercício 6
Lista de exercício 7
Videoaula sobre dinâmica molecular - Parte 1 ►