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  • Généralités

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  • Informações Gerais

    A disciplina BMM5701 Tópicos Gerais de Microbiologia - 2020 será realizada na forma de seminários às Quintas-feiras, ministrados entre 12:10h e13:40h, com início no próximo dia 06/08. 

    Estes seminários,  denominados Micro Webinar. serão acessados pelo google meet em link encaminhado na véspera do seminário. 

    Entre no link às 12:00h , de maneira a nâo ter problemas de acesso, pois alguns seminários terão muita procura. Use de preferencia seu e-mail USP para o acesso. 

    Serão 10 seminários segundo o cronograma, e o Pós Graduando deve assistir e fazer um resumo de pelo menos 8 dos 10 seminários, lendo e citando pelo menos uma das referências dadas pelo ministrante. Os resumos devem ter até 25 linhas, e devem ser preenchidos no questionário vinculado a cada seminário no site e-disciplinas, BMM 5701-2020. 

    Basta clicar sobre o tópico e irá aparecer a janela para você inserir o resumo. Estes poderão ser inseridos/modificados até o dia 20/10. 


  • Arsenal antibacteriano de Salmonella: efetores relacionados a L,D-transpeptidases

    Ethel Bayer Santos - Arsenal antibacteriano de Salmonella: efetores relacionados a L,D-transpeptidases
    Graduada em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Santa Catarina (2007), trabalhou com biologia celular e molecular do protozoário Trypanosoma rangeli. Realizou doutorado em Microbiologia e Imunologia na Universidade Federal de São Paulo (2008-2013), estudando a regulação gênica e expressão de proteínas durante a metaciclogênese de Trypanosoma cruzi. Durante estágio de doutorado na University of Texas at El Paso (2011-2012), estudou as vias de secreção do T. cruzi, caracterizando o seu conteúdo protéico e de ácidos nucléicos. Continuou seu treinamento e aperfeiçoamento durante pós-doutorado no MRC Center for Molecular Bacteriology and Infection, Imperial College London (2013-2015), onde estudou o T3SS de Salmonella Typhimurium e o papel das proteínas efetoras na modulação da célula hospedeira. Foi pesquisador no Instituto de Química da Universidade de São Paulo (2016-2018), onde identificou a função do T6SS de Xanthomonas citri e do T4SS de Stenotrophomonas maltophilia. Atualmente coordena um projeto Jovem Pesquisador FAPESP no Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo e estuda a função do T6SS de bactérias patogênicas. Tem interesse por sistemas de secreção e no mecanismo de ação das proteínas secretadas por Salmonella spp. durante interação com outras bactérias e células hospedeiras.  

    Bibliografia sugerida: Sibinelli-Sousa S, Hespanhol JT, Nicastro GG, et al. A Family of T6SS Antibacterial Effectors Related to l,d-Transpeptidases Targets the Peptidoglycan. Cell Rep. 2020;31(12):107813. doi:10.1016/j.celrep.2020.107813

    • Icône Test
      Arsenal antibacteriano de Salmonella: efetores relacionados a L,D-transpeptidases Test

      Resumo de até 25 linhas. 

      O resumo deve apresentar pelo menos uma das referencias citadas durante o seminário. 


      Disponible jusqu’à minuit le 17 novembre 2020
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      Sibinelli Souza et al 2020 Fichier

  • Role of Sirtuin1 in dendritic cells in obesity

    Niels Olsen Saraiva Câmara : "Role of Sirtuin1 in dendritic cells in obesity."

    Possui graduação em Medicina pela Universidade Federal do Ceará (1991), mestrado em Medicina (Nefrologia) pela Universidade Federal de São Paulo (1997), especialização em Imunologia de Transplantes pela Université de Tours (Diplome dês Études Appronfodies, França, 1997-1999), doutorado em Medicina (Nefrologia) pela Universidade Federal de São Paulo (2000), pós-doutorado pelo Imperial College London (2000-2003) e livre-docência pela Universidade Federal de São Paulo (Medicina) em 2006. Atualmente é Professor Titular do Departamento de Imunologia do Instituto de Ciências Biomédicas da Universidade de São Paulo (desde 2011). Professor visitante da Universidade de Tours, França em 2006. Tem experiência na área de Nefrologia e em Imunologia Celular e Aplicada, atuando principalmente nos seguintes temas: transplante renal, modelos experimentais de doenças renais agudas e crônicas, lesão de isquemia e reperfusão, células reguladoras e células-tronco em doenças renais. Mais recentemente, o laboratório vem estudando a interface microbiota, metabolismo celular e inflamação em modelos de alo e autoimunidade. Bolsa Produtividade Nivel 1A (2015-2020). Membro Titular da Academia de Ciências do Estado de São Paulo. Membro Titular da Academia Brasileira de Ciências 

    Bibliografia Sugerida: Ghirotto et al. Sirtuin in B lymphocytes metabolism and fuction. World J Exp Med. 2019 Jan 16;9(1):1-13.  doi: 10.5493/wjem.v9.i1.1. 

    meet.google.com/kpg-pfpf-inn


  • Burkholderia seminalis: a plant beneficial or animal pathogenic bacterium?

    Microwebinar dia 27/08 às 12:10

    Welington Luiz de Araujo   
    Burkholderia seminalis: a plant beneficial or animal pathogenic bacterium?

    Acesse a gravação pelo link 

    https://youtu.be/FiNoRmDR85U

    Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Londrina (1994), mestrado (1996) e doutorado (2000) em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas) pela ESALQ/Universidade de São Paulo com Estágio Sandwich no Plant Research International - Wageningen University and Research Center (Wageningen, Holanda). Pós-doutoramento no Departamento de Genética, ESALQ/USP (2000 a 2003) e USDA. Corvallis, EUA (2013). Livre Docência pelo Instituto de Ciências Biomédicas, ICB/USP (2016) na área de Microbiologia Ambiental. Professor do Depto de Microbiologia, ICB/USP desde 2011, onde coordena o LABMEM (Laboratório de Biologia Molecular e Ecologia Microbiana) e o NAP-BIOP (Núcleo de Apoio à Pesquisa em Diversidade e Bioprodutos da USP). Tem interesse no estudo da diversidade microbiana de diferentes ambientes, em especial do interior de plantas e de corpos de água doce. O LABMEM desenvolve projetos que visam entender mecanismos moleculares envolvidos na interação entre as bactérias Burkholderia seminalis, Curtobacterium flaccumfaciens, Methylobacterium spp., e o fungo Epicoccum sp. com a planta hospedeira, bem como com outros micro-organismos presentes no interior da planta. É orientador pleno dos Cursos de Doutorado em Microbiologia (Depto de Microbiologia, ICB/USP) e Bioctenologia Além de ser Membro da Comissão Técnica Nacional de Biossegurança (CTNBio). Tem experiência na área de Microbiologia, com ênfase em Bacterologia e Biologia Molecular, atuando principalmente nos seguintes temas: ecologia microbiana, biologia molecular, genômica e interação planta-micro-organismos. (Fonte: Currículo Lattes)

    Bibliografia Sugerida: 

    ROMERO-GUTIÉRREZ, et al. . Phenotypic traits of Burkholderia spp. associated with ecological adaptation and plant-host interaction. MICROBIOLOGICAL RESEARCH, v. 236, p. 126451, 2020. https://doi.org/10.1016/j.micres.2020.126451

    GONÇALVES et al. Environmental interactions are regulated by temperature in Burkholderia seminalis TC3.4.2R3. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, Article number: 5486, 2019. | https://doi.org/10.1038/s41598-019-41778-x.  

  • Antagonism of host antiviral defences by vacciniavirus

    Microwebinar. Quinta feira, 10/09 às 12:10

    meet.google.com/xep-kyrd-srm

    Jonas Dutra Albarnaz

    Antagonism of host antiviral defences by vacciniavirus    

    Bacharel em Ciências Biológicas pela UniversidadeFederal de Santa Catarina, e mestre e doutor em Microbiologia pela UniversidadeFederal de Minas Gerais. Realizou estágio de doutorado-sanduíche na Universityof Florida (Gainesville). Durante o doutorado, investigou a relevânciafuncional das vias sinalizadoras da MAPK p38 e de PAK1 durante a infecção pelovírus vaccínia, e de MEK/ERK durante a infecção pelo vírus da febre amarela. Atualmenteé pesquisador pós-doutor no laboratório de Geoffrey Smith na University ofCambridge e investiga os mecanismos virais de evasão à resposta imune dohospedeiro, usando o vírus vaccínia como modelo.

    http://lattes.cnpq.br/5273027440047388

    https://www.infectiousdisease.cam.ac.uk/directory/dr-jonas-dutra-albarnaz


    Bibliografia sugerida: Albarnaz JD, Torres AA, Smith GL.Modulating Vaccinia Virus Immunomodulators to Improve Immunological Memory. Viruses. 2018 Feb 28;10(3):101. doi: 10.3390/v10030101.

    Lior Soday, Yongxu Lu, Jonas D Albarnaz, Colin T R Davies, Robin Antrobus, Geoffrey L Smith, Michael P Weekes. Quantitative Temporal Proteomic Analysis of Vaccinia Virus Infection Reveals Regulation of Histone Deacetylases by an Interferon Antagonist. Cell Rep. 2019 May 7;27(6):1920-1933.e7. doi: 10.1016/j.celrep.2019.04.042.



  • A novel interbacterial toxin withunprecedented activity on DNA

    MicroWebinar quinta-feira dia 17/09 às 12:10

    meet.google.com/nqd-ywds-uyj

    Marcos Henrique de Moraes    
    A novel interbacterial toxin withunprecedented activity on DNA    

    Bacharel em Ciências Biológicas pela UniversidadeEstadual de Campinas, mestre em Genética e Biologia Molecular da UniversidadeEstadual de Campinas, onde trabalhou no desenvolvimento de linhagens atenuadasde Salmonella enterica. Doutor pela University of Florida (Gainesville),estudando mecanismos de infecção de plantas (tomates) for Salmonella.Atualmente é pesquisador pós-doutor no laboratório de Joseph Mougous na University of Washington etrabalha na caracterização de novas toxinas antibacterianas.

     https://goby-kazoo-sjk3.squarespace.com/



    Bibliografia Sugerida: Mok, B.Y., de Moraes, M.H., Zeng, J. et al. A bacterial cytidine deaminase toxin enables CRISPR-free mitochondrial base editing. Nature 583, 631–637 (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2477-4

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      Mok et al., 2020 Fichier
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      A novel interbacterial toxin withunprecedented activity on DNA Test

      Resumo de até 25 linhas. 

      Disponible jusqu’à minuit le 17 novembre 2020

  • Pandemia de coronavírus e o que aguardar para o retorno

    Ministrante: Edison Luis Durigon

     dia 24/09 às 12:10. 

    Possui Doutorado em Ciências na área de Microbiologia pela Universidade de São Paulo em 1989 e Pós Doutorado em Virologia no CDC- Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta , GA, USA ( 1990 a 1994). Membro da Organização Mundial da Saúde - OMS como representante da America do Sul no WHO Biosafety Advisory Group no ano de 2004. Atualmente é Professor Titular de Virologia e Coordenador do Laboratório BSL3+ da Universidade de São Paulo - USP, Departamento de Microbiologia do Instituto de Ciências Biomédicas - ICB. Chefe do Depto de Microbiologia ICBUSP desde outubro de 2019. Responsável pela disciplina de Pós Graduação de Biossegurança e Biocontenção do Departamento de Microbiologia do ICB desde 2005. Tem experiência na área de Microbiologia, com ênfase em Virologia, atuando principalmente nos seguintes temas: diagnóstico clínico e molecular, Viroses humanas e animais, Vírus exantemáticos, Vírus respiratórios, Vírus Silvestres, Vírus emergentes , Diversidade genética viral, Biossegurança e Biocontenção Nível BSL 2 e BSL 3. (Fonte: Currículo Lattes)

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      Pandemia de coronavírus e o que aguardar para o retorno Test

      Resumo de até 25 linhas. 

      O resumo deve apresentar pelo menos uma das referencias citadas durante o seminário. 

      Disponible jusqu’à minuit le 17 novembre 2020

  • Antivirais: mecanismos, estratégias e problemas.

    Microwebinar. Dia 1 de outubro, quinta-feira, às 12:10
    Paulo Marinho de Andrade Zanotto

    Antivirais: mecanismos, estratégias e problemas. 

    meet.google.com/izr-xfjo-rmo


    Possui graduação em Biologia pela Universidade de São Paulo (1981), mestrado em Molecular Virology - University of Florida (1990) e doutorado em Virologia - University of Oxford (1995). Atualmente é professor doutor da Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Microbiologia, com ênfase em Virologia, atuando principalmente nos seguintes temas: evolucao de flavivirus, baculovirus, filogenia viral, arboviroses emergentes e filogenia molecular. h=31 , 136 publicações, 4817 citações https://publons.com/researcher/1793308/paolo-m-de-a-zanotto/

  • What can structural biology tell us about predatory bacteria?

    MicroWebinar. Thursday, October, 8th, 2020. 12:10

    What can structural biology tell us about predatory bacteria?

    Andrew Lovering

    https://www.birmingham.ac.uk/staff/profiles/biosciences/lovering-andrew.aspx

    Andrew was born in Wales and did his undergraduate course in Biochemistry at the University of Birmingham, followed by a PhD in structural biology at the University of Birmingham. He then moved to Vancouver (Canada) to perform a postdoc at the group of Natalie Strynadka the University of British Columbia. In 2010 he returned to the UK to start his own group looking into how “living antibiotics” like the bacterium Bdellovibriobacteriovorus could be used to tackle bacterial pathogens. Andrew is currently a Senior Lecturer at the School of Biosciences at the University of Birmingham. He was awarded the EMBO YoungInvestigator and he is currently a Wellcome Trust Investigator.

     

    Suggested reading

    MeekRW, Cadby IT, Moynihan PJ, LoveringAL. Structural basis for activation of a diguanylate cyclaserequired for bacterial predation in Bdellovibrio. Nat Commun. 2019 Sep 9;10(1):4086. doi:10.1038/s41467-019-12051-6.


    Video do seminário

    https://drive.google.com/file/d/1dBLb1UGxQ0pEn3-ZFN19e55oaFMapjaU/view?usp=sharing


  • Cell growth and morphogenesis on the verge of Eukaryogenesis

    Microwebinar. Dia 15 de outubro, quinta-feira, às 12:10

    Alexandre Bisson

    Cell growth and morphogenesis on the verge of Eukaryogenesis

    Entrar com o Google Meet  meet.google.com/xaq-eent-xqa

    https://www.bissonlab.com/

    http://lattes.cnpq.br/4995492787854131

    Bacharel em Química pela Universidade de São Paulo, mestre e doutor em Bioquímica pelo Instituto de Química da Universidade de São Paulo, estudando mecanismos da regulação da divisão celular em Bacillus subtilis. Realizou dois estágios sanduíches na Harvard Medical School e na Duke University. Foi pesquisador pós-doutor no laboratório de Ethan Garner na Harvard University. Em 2019 ele mudou para a Brandeis University para iniciar seu próprio grupo de pesquisa focado em estudar mecanismos de organização celular e comportamento de arqueobactérias.

    Bibliografia recomendada: Bisson-Filho AW, Zheng J, Garner E.Mol Biol Cell. Archaeal imaging: leading the hunt for new discoveries. 2018 Jul 15;29(13):1675-1681. doi: 10.1091/mbc.E17-10-0603.

    M F  Abdul-Halim, S Schulze, A DiLucido, F Pfeiffer, A W Bisson Filho, M Pohlschroder. Lipid anchoring of Archaeosortase substrates and midcell growth in Haloarchaea. M Bio 2020. DOI: 10.1128/mBio.00349-20