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CEN5789 - Genômica e Bioinformática (2024)
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2024
CENA
CEN
CEN5789--2024
Aula prática 3: Bancos de dados de genes ortólogos...
Topic outline
General
Aula teórica 1: Introdução a disciplina e Bancos de dados biológicos e Ferramentas básicas de bioinformática
Aula prática 1: Introdução no sistema operacional LINUX, programação em shell (bash), alinhamento pareado de sequências, BLAST
Aula teórica 2: Genômica: fluxo de informação na célula, estrutura de genomas, estratégias de sequenciamento de genomas
Aula teórica 3: Alinhamento de sequências (pareado e múltiplo): algoritmos exatos e heurísticos
Aula teórica 4: Estratégias para a montagem de genomas de novo e guiado por referencia, diferencias, vantagens, tipos de dados. Avaliação de montagens.
Aula prática 2: Montagem de genomas. Avaliação de montagens, Anotação de genomas
Aula teórica 5: Anotação estrutural e funcional de genomas
Aula teórica 6: Pangenoma e Genômica comparativa
Aula prática 3: Bancos de dados de genes ortólogos, identificação de genes ortólogos e parálogos.
Aula teórica 7: Transcriptômica: anotação genomas, análise de expressão diferencial de genes, redes de co-expressão
Aula prática 4: Análise de dados de transcriptómica e introdução a linguagem R
Aula teórica 8: Composição de microbiomas: analise taxonômico
Aula teórica 9: Metagenômica
Apresentação de projeto semestral
Comparative Genomics OMA
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Aula teórica 6: Pangenoma e Genômica comparativa
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Aula teórica 1: Introdução a disciplina e Bancos de dados biológicos e Ferramentas básicas de bioinformática
Aula prática 1: Introdução no sistema operacional LINUX, programação em shell (bash), alinhamento pareado de sequências, BLAST
Aula teórica 2: Genômica: fluxo de informação na célula, estrutura de genomas, estratégias de sequenciamento de genomas
Aula teórica 3: Alinhamento de sequências (pareado e múltiplo): algoritmos exatos e heurísticos
Aula teórica 4: Estratégias para a montagem de genomas de novo e guiado por referencia, diferencias, vantagens, tipos de dados. Avaliação de montagens.
Aula prática 2: Montagem de genomas. Avaliação de montagens, Anotação de genomas
Aula teórica 5: Anotação estrutural e funcional de genomas
Aula teórica 6: Pangenoma e Genômica comparativa
Aula prática 3: Bancos de dados de genes ortólogos, identificação de genes ortólogos e parálogos.
Aula teórica 7: Transcriptômica: anotação genomas, análise de expressão diferencial de genes, redes de co-expressão
Aula teórica 8: Composição de microbiomas: analise taxonômico
Aula teórica 9: Metagenômica
Apresentação de projeto semestral
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Aula teórica 7: Transcriptômica: anotação genomas, análise de expressão diferencial de genes, redes de co-expressão