Apresentação da
disciplina e Informações Importantes
Docentes
Suely Lopes Gomes (sulgomes@iq.usp.br),
B12T sala 1211
Daniela Basseres (basseres@iq.usp.br),
B12T sala 1208
Conteúdos
A
disciplina será desenvolvida em dois blocos: (i) Expressão gênica em bactérias
e bacteriófagos e (ii) Expressão gênica em eucariotos.
Organização
As atividades da disciplina terão diferentes
formatos:
Aulas teóricas: aulas presenciais
ministradas de acordo com o cronograma.
Exercícios para nota: após cada aula
teórica, será disponibilizado um questionário na plataforma e-disciplinas, que
deve ser respondido até a data da aula seguinte. Este questionário pode conter questões
discursivas e/ou questões de múltipla escolha sobre o tema abordado na aula. A
média das notas dos exercícios será calculada excluindo-se do cálculo as duas
menores notas, e esta média será usada para compor parte da média final do/a
estudante (ver avaliação).
Materiais de apoio: Além da
bibliografia indicada, serão disponibilizados materiais de apoio na plataforma
e-disciplinas, incluindo os slides das aulas, vídeos e outros materiais. Após
cada aula teórica, uma lista de exercícios discursiva será compilada pelas
docentes. Estas listas de exercícios não serão entregues ou avaliadas para
nota, mas seu intuito é servir de guia de estudo para as provas, visando
aprofundar, aplicar e consolidar os conteúdos ministrados. As dúvidas relativas
às listas devem ser discutidas no fórum de dúvidas via e-disciplinas.
Fórum de dúvidas: Este fórum
estará aberto para a comunicação entre todos durante todo o semestre.
Recomendamos que as dúvidas relativas aos exercícios e/ou aulas sejam postadas
e respondidas pelos próprios alunos, de maneira colaborativa. O fórum de
dúvidas e comentários sobre as aulas e exercícios é uma atividade extremamente
importante. As docentes irão monitorar o fórum e intervir com comentários e
esclarecimentos quando necessário.
Avaliações: A média final
do/a estudante integrará as notas das duas provas presenciais e as notas dos
exercícios realizados na plataforma e-disciplinas através do seguinte cálculo:
Nota final= 0,9 x (média das avaliações) + 0,1 (média
dos exercícios)
Em princípio, não haverá avaliações
substitutivas. Entretanto, UMA avaliação substitutiva poderá ser
considerada no final do curso em data a ser marcada somente para alunos que
perderem uma avaliação mediante existência de justificativa pertinente a ser
avaliada pelas docentes. Reiteramos que problemas de qualquer natureza em
relação às avaliações devem ser PRONTAMENTE comunicados às
docentes.
Aprovação
Alunos que obtiverem média igual ou superior a
cinco serão aprovados. Os alunos que tiverem média inferior a três serão
reprovados.
Os alunos que tiverem média entre três e cinco
terão direito a fazer uma prova de recuperação em data a ser marrcada. Esta
prova versará sobre todo o conteúdo da disciplina. Para fins de aprovação, a
nota da prova de recuperação terá peso 2 e a média da avaliação precedente terá
peso 1.
Bibliografia
Artigos recomendados para leitura
- Regulation by
destruction: design of the sigma E envelope stress response (CurrOpinionMicro, 11, 535, 2008); Regulation of
alternative sigma fator use (AnnuRevMicro, 65,
37, 2011); Transcriptional switching, modulation of sigma 70 activity (FEMS
MicroRev, 34, 646, 2010)
- Stress Responses-Heat (Encyclopedia of Microbiology,
3rd edition, 2009); Regulation of the heat-shock response (Yura, Curr
OpinionMicro, 2, 153, 1999)
- Activating transcription in Bacteria (Annu Rev
Microbiol, 66, 125, 2012) ; Lac
repressor, DNA looping, three operators cooperate (EMBO J 9, 973, 1990; EMBO J 13,
3348, 1994); Crystal Structure of Repressor (Science 271, 1247, 1996)
- Lambda switch- A tale of two repressors (JMB 409, 14, 2011); How lambda repressor
and cro work (Cell 19,1,1980). Lambda
gene regulation (Curr Opinion Gene dev-2005)
- Two-component systems evolution (Annu Rev Micro, 66, 325,2012); Bacterial sensor kinases
(Annu Rev Micro, 64, 539, 2010); Signal
transduction in bacterial chemotaxis (BioEssays 28, 9, 2005)
- Regulatory RNAs in Bacteria (Storz, Cell, 136, 615, 2009); Bacterial antisense
RNAs (Annu Rev Genet 44, 167, 2012);
DsrA RNA regulates RpoS (PNAS 95,
12462, 1998); MicF - an antisense RNA gene (JMB 313, 1, 2001)
- Genome regulation by long noncoding RNAs (Annu Rev
Biochem. 2012; 81: 145-66)
LIVROS TEXTO RECOMENDADOS (ou originais em inglês)
·
Lehninger
Princípios de Bioquímica, 5a. Edição, Editora Savier. D.L. Nelson; M.M. Cox.
·
Biologia
Molecular Básica 5ª Edição. Arnaldo Zaha; Henrique Bunselmeyer Ferreira;
Luciane M. P. Passaglia
·
DNA
Recombinante: Genes e Genomas 3ª Edição.
James D. Watson; Richard M. Myers; Amy A. Caudy; Jan
A. Witkowski
·
Genética Molecular Básica -
C.F. Menck & M. Van Sluys. GEN/Guanabara Koogan. 1ª edição.
·
Biologia Molecular do Gene -
J. Watson et al. 7a. edição
. Genes IX, 9ª Edição. Benjamin Lewin