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BMM5729 - Análise Sistêmica e Engenharia do Metabolismo Microbiano (2020)
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COBRA - Constraint Based Reconstruction Analysis
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Programa Preliminar BMM5729
Texto Metabolismo
Link para aula 1 - Metabolismo heterotrofico
Aula MetabolismoI- heterotrofico
Link Aula 1 Metabolismo
Link aula Metabolismo II – autotróficos 13
aula metabolismo II autotróficos
Arquivo com vias heterotroficas adicionais
Link para Aula 2 - Metabolismo autotrófico
Metabolismo III Biossíntese F 2020
Aula Metabolismo III - Biossíntese
Tabela Neidhardt
Video aula 1 - redes metabólicas
Vídeo Aula 2 - Redes Metabólicas (15.05.20200
Slides Redes Metabólicas
Planilha final
Vídeo aula 3 - Redes metabólicas
Bioprocessos Microbianos
Texto Rafael Nahat
Bioprocesso Microbianos 2
Bioprocessos 2 - V2 - Aula Rafael
Bioprocesso 3
Bioprocessos 4
Aula Rafael 20.05.2020
Aula Rafael 22.05.2020
Vídeo Aula 3 Rafael
Video Aula 4 Rafael
Exercício - Planilha Original
Exercício - Gabarito Parcial
Exercício - Gabarito até Ex. 4
Exercício 1 a 6 - Planilha
Exemplo Monte Carlo
Exercicio 1 a 6 Gabarito
Aula Carol - Balanços Elementos e Redox
Capítulo Livro 1
Capítulo Livro 2
Capítulo de Livro 3
Exemplo feito em aula no octave
Exercicio - Slide 27
Vídeo Aula Carol
Cinética Bioprocessos
Modelo Batelada
Octave baletada
Octave fbatelada
Modelo Batelada Alimentada
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Octave fbatalim
Modelo Continuo
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Vídeo Aula Rosane
slides Aula Rosane
Octave Continuo 2
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Aula Juliana
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Figura 3D - Rafael
Vídeo Aula Reconstrução Rede Metabólica
Aula Carol - Estado estacionário
Imagem rede B. sacchari
Rede B. sacchari - Metatool
Scripts do Metatool para Octave
Script com exemplos e exercicio feito em aula
Script com comandos usados em aula para rodar o Metatool
Vídeo da aula
Slides da aula
E. coli core
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Modelo Linear
Aula_Galo
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Metatool
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Slides da aula
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Arquivo em pdf da aula de Redirecionamento de fluxos metabólicos
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Instruções para o Trabalho
Mendonça et al 2017
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