A disciplina trata das interações entre a atmosfera e as plantas na escala microclimatológica. Ênfase é dada na interação entre a radiação solar com a copa das plantas e aos mecanismos que controlam o transporte de massa e energia em sistemas vegetados. Os princípios básicos da arquitetura dos dosséis vegetativos são estudados como base para a compreensão da absorção da energia radiante pela vegetação. Conceitos de mecânica dos fluídos são aplicados aos fluxos atmosféricos buscando-se o entendimento dos processos de transporte turbulento e sua implicação no balanço de massa e energia em sistemas vegetados. As implicações ecofisiológicas dos processos físicos estudados são também abordadas, assim como os efeitos do acoplamento vegetação-atmosfera. A disciplina também pretende introduzir os alunos aos procedimentos instrumentais para medidas na escala microclimatológica em sistemas agrícolas e florestais.