Índice do Help

1.1. O que é COM?

1.2. Como é o equipamento?

1.3. Como funciona o programa?

1.3.1. Configurando o programa para seu micro

1.3.2. Botões de comando

1.3.3. Habilitando gráficos

1.3.4. Construindo gráficos

1.3.5. Salvando gráficos

1.3.6. Iniciando um novo gráfico

1.3.7. Visualizando os gráficos

1.4. Sugestões de roteiros para o uso do software

1.4.1. Exemplo de roteiro utilizado com o simulador em cursos de graduação

1.5. Dicas de uso

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O que é Com?
1.1. O que é COM?

COM (consumo de oxigênio por mitocôndrias isoladas). Simulador do consumo de oxigênio por mitocôndrias isoladas, tem como objetivo geral o desenvolvimento da capacidade de planejar experimentos e interpretar seus resultados. Os objetivos específicos são o melhor entendimento da cadeia de transporte de elétrons e fosforilação oxidativa e de como se comportam os substratos, inibidores e desacopladores.

Esse simulador permite aos usuários fazer uma série de testes, através dos compostos disponíveis de uma maneira mais rápida, econômica e prática, se comparado à execução de tais medidas em laboratório. Os compostos podem ser de origem biológica ou sintética, e podem influenciar o consumo de oxigênio por mitocôndrias, dependendo de como utilizados. Para se saber como atuam esses compostos é necessário adiciona-los à cela de incubação com mitocôndria e interpretar os gráficos produzidos.

A proposta pedagógica desse programa é desfiar o usuário a descobrir a função dos diferentes compostos disponíveis, na cadeia transportadora de elétrons e fosforilação oxidativa.

Os testes planejados têm uma resposta direta, através dos gráficos de oxigênio consumido por tempo e uma confirmação através da variação do potencial de membrana provocado pelas substâncias adicionadas. Como nos experimentos reais, a exatidão e a rapidez com que as respostas são obtidas dependem da adequação do experimento planejado, incluídos os controles adequados, e da análise dos resultados.


Como é o equipamento?
1.2. Como é o equipamento?

O equipamento consiste de uma cela de incubação, com temperatura controlada por um banho de água (c). Essa cela é usada sobre um agitador magnético (d), que tem por função homogeneizar a suspensão de mitocôndrias. Na parte superior da cela (a) existe um orifício da largura aproximada de uma agulha, onde através de uma micro seringa, faz-se a adição dos compostos que serão estudados. Na lateral inferior da cela, existe uma membrana (e), permeável somente à gases, que protege o eletrodo sensível à oxigênio (f).

O eletrodo é acoplado a um registrador, que traça um gráfico de acordo com a concentração de oxigênio ou .


Como funciona o Programa?
1.3. Como funciona o Programa?

1.3.1. Configurando o programa para seu micro

1.3.2. Botões de comando

1.3.3. Habilitando gráficos

1.3.4. Construindo gráficos

1.3.5. Salvando gráficos

1.3.6. Iniciando um novo gráfico

1.3.7. Visualizando os gráficos


Configurando o Programa para seu micro
1.3.1. Configurando o programa para seu micro

Antes de iniciar o uso do programa, é necessário configura-lo de acordo com o micro em que este está instalado.

Existem quatro configurações possíveis de serem feitas:

•486 SX/DX

•486 DX 4 100 Mhz

•Pentium 75/90 Mhz

•Pentium 100 Mhz ou +

Para escolher a configuração, vá ao menu “Opções”, dentro deste, escolha “Configurar micro” e, então, selecione um dos itens mostrados acima.

Uma vez feita esta configuração o programa gardará a escolha e, toda vez que for iniciado, ela será a configuração padrão. A qualquer momento, entretanto, pode-se mudar a configuração do micro.


Botões de Comando
1.3.2. Botões de comando

1.3.2.1.	Novo

Limpa a tela para inicialização de um novo gráfico.

1.3.2.2.	Sair

Finaliza o programa

1.3.2.3.	Iniciar

Inicia a plotagem de um novo gráfico. Esta opção somente estará ser ativada após a inicialização do programa ou após um clique no botão “Novo”.

Caso esteja sendo visualizado um gráfico antigo, o programa exibe automaticamente a área atual de plotagem. Veja Visualizando os gráficos.

1.3.2.4.	Mitocôndrias

Adiciona mitocôndria à cela de incubação, enquanto não for adicionado mitocôndria o registrador não apresenta alteração (reta horizontal) e a adição de compostos estará desabilitada.


Habilitando gráficos
1.3.3. Habilitando gráficos

O COM dispõe de 2 gráficos de plotagem: Consumo de Oxigênio e Potencial Elétrico.

Pode-se habilitar qualquer dos gráficos ou ambos, deixando-se ao menos um habilitado, de modo que somente sejam plotadas as informações desejadas.

Para se habilitar ou desabilitar  qualquer dos gráficos usa-se a função "Habilitar gráficos" no menu "Opções".

O programa sempre iniciará com a última configuração escolhida.


Construindo gráficos
1.3.4. Construindo gráficos

Para iniciar a construção de um gráfico a tela deve estar limpa (para limpa-la, clique no botão "Novo"). O botão "Iniciar" liga o registrador. Os compostos só serão habilitados quando for adicionado mitocôndria (botão "Mitocôndria") à cela de incubação, pois sem mitocôndria não haveria efeito nenhum.


Salvando gráficos
1.3.5. Salvando gráficos

Os dois gráficos da tela do COM podem ser salvos em disco, de modo que possam ser editados posteriormente. Os gráficos são salvos no formato bitmap do Windows (extensão .bmp), de modo que podem ser editados em qualquer editor para este padrão de arquivos como o  Microsoft© Paint.

Para salvar os gráficos clique na função “Salvar gráficos...” dentro do menu “Arquivo” ou clique no botão de salvamento:


Copiando gráficos
1.3.6. Copiando gráficos

É possível copiar os dois gráficos da tela do COM (gráfico de Consumo de Oxigênio e de Potencial Elétrico) para a Área de Transeferência do Microsoft© Windows, de modo que, após feita a cópia, podem ser colados em outros programas para uso em documentos.

Para realizar a cópia dos gráficos, selecione a função “Copiar gráficos” dentro do menu “Arquivo”.


Visualizando os gráficos
1.3.7. Visualizando os gráficos

Para se visualizar todos gráficos que já foram construídos, selecione, nas abas de movimentação:

o número do gráfico que se deseja visualizar.

Caso se esteja construindo um gráfico, as abas estarão desabilitadas. Para habilitá-las, finalize a construção do gráfico atual clicando no botão “Novo”.


Sugestões para utilização do software
1.4. Sugestões para utilização do software

Um procedimento que tem se mostrado muito efetivo é o seguinte: após uma breve introdução oral teórica sobre o tema a ser estudado, submete-se os alunos à utilização do simulador, através do qual eles devem ser capazes de chegar por si próprios ao modo de funcionamento da cadeia de transporte de elétrons e fosforilação oxidativa, verificando o papel de cada uma das substâncias listadas no simulador isoladamente, ou a conseqüência de misturas delas. Todo o processo de descoberta é feito sem consultar nenhum outro tipo de material didático além do software. A utilização do simulador pode ou não ser acompanhada por um roteiro de estudo formal; o nível de dificuldade solicitado durante sua utilização depende exclusivamente das tarefas que os alunos deverão executar, seja respondendo questões referentes ao assunto em estudo ou através de sua utilização não direcionada, possibilitando que os alunos formulem e testem suas próprias hipóteses. Esta forma de abordagem do conteúdo impõe a necessidade de participação intensa dos alunos, professores e monitores durante as aulas.

Veja: Exemplo de roteiro utilizado com o simulador em cursos de graduação.


Exemplo de roteiro
1.4.1 EXEMPLO DE ROTEIRO UTILIZADO COM O SIMULADOR EM CURSOS DE GRADUAÇÃO

1) Identificar entre as substâncias alistadas no software as que estimulam e as que não têm efeito sobre o consumo de oxigênio pela mitocôndria. Preencha a Tabela I.

Tabela I

2) Habilite o gráfico de potencial elétrico (Δψ) x tempo e explique o efeito observado ao se adicionar as substâncias que estimularam o consumo de oxigênio no exercício anterior.

3) Como você classificaria os compostos que estimularam o consumo de oxigênio em mitocôndrias isoladas quanto ao seu modo de ação na cadeia de transporte de elétrons?

4) Das substâncias classificadas como “sem efeito”, quais passam a ser efetivas quando adicionadas após cada substância que estimulou o consumo de oxigênio (Tabela I)? Preencha a Tabela II.

Tabela II

5) Baseado na Tabela II, responda:

a. Que substância(s) atua(m) como desacoplador(es)? Justifique.

b. Que substância(s) atua(m) como inibidor(es) da ATP sintase? Justifique.

6) Identificar os substratos e os inibidores para cada um dos sítios referidos.

7) O composto A inibe o consumo de oxigênio e a síntese de ATP por mitocôndrias isoladas. A medida destes parâmetros em presença de um desacoplador permitiria determinar o modo de ação do composto A?


Dicas de uso
1.5. Dicas de uso

1.5.1.Interrompendo a construção

Caso queira interromper a construção e posteriormente continuar a construir o mesmo gráfico, sem inicializar um novo, clique o botão de espaço de seu teclado. Ele serve tanto para interromper quanto para continuar a construção.

1.5.2.Rever o texto inicial

Caso queira rever o texto apresentado na entrada do aplicativo, clique o botão do mouse sobre o menu "?" e selecione a opção "Texto de Apresentação".

1.5.3.Usando o botão direito do mouse

Clicando o botão direito do mouse, sobre a janela do aplicativo, você encontrará atalhos para algumas tarefa. Estas tarefas são: "Novo", "Iniciar", "Visualizar", "Salvar" e "Sair".

1.5.4.Usando teclas de atalho

Para acelerar o seu trabalho, ou caso seu mouse esteja com problemas, utilize as teclas de atalho, pressinando o botão Alt e a letra grifada, da opção desejada, simultaneamente. Veja o menu e os botões de comando.