Passer au contenu principal
Panneau latéral
Disciplinas »
2025
2024
2023
2022
2021
2020
2019
2018
2017
2016
2015
2014
2013
2012
AACCs/FFLCH
Pró-Reitoria de Pós-Graduação
Outros
Suporte »
Acesso
Perfis
Ouvintes
Docentes
Criação de Disciplinas da USP
Documentação
HelpDesk e Contato
Guia de uso
Sobre
Français (fr)
Deutsch (de)
English (en)
Español - Internacional (es)
Français (fr)
Italiano (it)
Português - Brasil (pt_br)
Rechercher
Fermer
Rechercher
Activer/désactiver la saisie de recherche
Acessar
CEN5789 - Genômica e Bioinformática (2024)
Accueil
Cours
2024
CENA
CEN
CEN5789--2024
Généralités
Aperçu des sections
Généralités
Aula teórica 1: Introdução a disciplina e Bancos de dados biológicos e Ferramentas básicas de bioinformática
Aula prática 1: Introdução no sistema operacional LINUX, programação em shell (bash), alinhamento pareado de sequências, BLAST
Aula teórica 2: Genômica: fluxo de informação na célula, estrutura de genomas, estratégias de sequenciamento de genomas
Aula teórica 3: Alinhamento de sequências (pareado e múltiplo): algoritmos exatos e heurísticos
Aula teórica 4: Estratégias para a montagem de genomas de novo e guiado por referencia, diferencias, vantagens, tipos de dados. Avaliação de montagens.
Aula prática 2: Montagem de genomas. Avaliação de montagens, Anotação de genomas
Aula teórica 5: Anotação estrutural e funcional de genomas
Aula teórica 6: Pangenoma e Genômica comparativa
Aula prática 3: Bancos de dados de genes ortólogos, identificação de genes ortólogos e parálogos.
Aula teórica 7: Transcriptômica: anotação genomas, análise de expressão diferencial de genes, redes de co-expressão
Aula prática 4: Análise de dados de transcriptómica e introdução a linguagem R
Aula teórica 8: Composição de microbiomas: analise taxonômico
Aula teórica 9: Metagenômica
Apresentação de projeto semestral
Avisos
Forum
Grupos
Fichier
Non disponible à moins que : Vous soyez membre de
T-CEN5789-1
Dúvidas
Forum
Entrega Apresentacões Tema Teórico
Devoir
Programação semanal
Fichier
Material para Sessões Práticas
URL
Aller à…
Généralités
Aula teórica 1: Introdução a disciplina e Bancos de dados biológicos e Ferramentas básicas de bioinformática
Aula prática 1: Introdução no sistema operacional LINUX, programação em shell (bash), alinhamento pareado de sequências, BLAST
Aula teórica 2: Genômica: fluxo de informação na célula, estrutura de genomas, estratégias de sequenciamento de genomas
Aula teórica 3: Alinhamento de sequências (pareado e múltiplo): algoritmos exatos e heurísticos
Aula teórica 4: Estratégias para a montagem de genomas de novo e guiado por referencia, diferencias, vantagens, tipos de dados. Avaliação de montagens.
Aula prática 2: Montagem de genomas. Avaliação de montagens, Anotação de genomas
Aula teórica 5: Anotação estrutural e funcional de genomas
Aula teórica 6: Pangenoma e Genômica comparativa
Aula prática 3: Bancos de dados de genes ortólogos, identificação de genes ortólogos e parálogos.
Aula teórica 7: Transcriptômica: anotação genomas, análise de expressão diferencial de genes, redes de co-expressão
Aula teórica 8: Composição de microbiomas: analise taxonômico
Aula teórica 9: Metagenômica
Apresentação de projeto semestral
►
Aula teórica 1: Introdução a disciplina e Bancos de dados biológicos e Ferramentas básicas de bioinformática